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【2026年最新版】東京都のシステム・アプリ開発で使える助成金まとめ!DX推進・経営力強化に向けた創意工夫チャレンジ促進事業を徹底解説

    更新日:

    2026/02/02

    公開日:

    2026/02/02

    【2026年最新版】東京都のシステム・アプリ開発で使える助成金まとめ!DX推進・経営力強化に向けた創意工夫チャレンジ促進事業を徹底解説

      【2026年最新版】東京都のシステム・アプリ開発で使える助成金まとめ!DX推進・経営力強化に向けた創意工夫チャレンジ促進事業を徹底解説

      ※この記事は令和8年度(2026年度)東京都予算案(2025年1月発表)の速報値に基づいています

      東京都は2026年01月30日に2026年度(令和8年度)の当初予算案を発表し、中小企業の成長を加速させるため、総額数百億円規模の予算を投じる「産業労働局」の制度を公開しました。特にシステム改修、独自アプリの開発、AI導入などを検討している企業が、真っ先にチェックすべき4つの制度をご紹介します。

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      2026年度最新、要注目の4つの助成制度

      2026年、システム・アプリ開発や設備投資における東京都の助成金で最注目の制度は以下の4つです。

      1. 経営力強化に向けた創意工夫チャレンジ促進事業【予算103億円・新規】
      2. DX推進トータルサポート事業【予算31億円・新規】
      3. 中小企業収益力強化サポート事業【予算22億円・新規】
      4. 躍進的な事業推進のための設備投資支援事業【予算191億円・前年144億円】

      それぞれ詳しく見ていきましょう。

      1. 経営力強化に向けた創意工夫チャレンジ促進事業【予算103億円・新規】

      中小企業の成長を見据えた業務改善や新事業の展開を後押しするため、必要な経費の一部を助成するとともに、専門家によるアドバイスを実施。

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      区分設備導入等による業務改善コース新市場・新分野進出コース賃上げ促進コース
      概要設備導入を主軸とした業務改善の後押しによる経営力強化新事業の実施による収益の柱の多角化を後押し設備導入を主軸とした業務改善の後押しによる経営力強化 +賃上げ
      対象者直近決算期の営業利益が前々期と比較して減少している。又は、直近決算期において損失を計上した企業直近決算期の営業利益が前々期と比較して減少している。又は、直近決算期において損失を計上した企業直近決算期の営業利益が前々期と比較して減少している。又は、直近決算期において損失を計上した企業
      スキーム助成金 + 専門家派遣助成金+ 専門家派遣(計画策定)+ 専門家派遣(事業化支援)助成金 + 専門家派遣
      助成率2/3通常:2/3
      賃上げ計画を策定した場合:3/4(更に小規模事業者の場合:4/5)
      通常:3/4(小規模事業者の場合:4/5)
      助成上限額600万円1,000万円600万円
      採択予定件数700件100件500件

      令和8年度(2026年度)東京都予算案の概要資料上では新たな制度となっていますが、01月30日時点で公表されている上記の内容から考えると、2024年度と2025年度の以下制度と、とても似ている印象を受けました。

      ・2024年度の「新たな事業環境に即応した経営展開サポート事業」
      ・2025年度の「事業環境変化に対応した経営基盤強化事業(一般コース)」

      弊社では、システム・アプリ新規開発、またシステム・アプリの既存改修にて同制度での採択実績が多数あり、完全成功報酬型(着手金0円)でご支援しております。

      【採択事例】薬局業界に変革をもたらすメディナビの新規システム開発 助成制度が支えた成長戦略

      【採択事例】都の助成金活用でシステム開発を行い、更なる人材育成ビジネスの拡大を目指す

      【採択事例】ヘルスケア特化型BIツールの追加開発による医療データ活用の強化

      2. DX推進トータルサポート事業【予算31億円・新規】

      中小企業が最新のデジタル技術等を活用し、生産性向上を図ることで、企業の持続的な成長・発展を支援するとともに、賃金の引上げを後押しする制度です。

      そもそもの300社がどのように選定されるのか、詳細を待ちたいですね。

      3. 中小企業収益力強化サポート事業【予算22億円・新規】

      物価高騰により事業継続に苦心している中小企業に対し、収益力向上に向けた計画策定や実行に向けた伴走支援・経費の一部助成などを実施します。

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      項目中小企業収益力強化サポート事業 内容
      支援対象物価高騰により事業継続に苦心している中小企業
      主な支援内容コンサルタント派遣、計画策定や実行に向けた伴走支援、経費の一部助成
      助成上限額300万円
      助成率2/3(通常)
      3/4(賃上げ策定企業)
      4/5(小規模企業)
      採択予定件数500社

      4.躍進的な事業推進のための設備投資支援事業【予算191億円・前年144億円

      中小企業の発展に向け、競争力の強化や生産性向上などを目指す際に必要となる設備等の導入に要する経費の一部を支援する制度です。また併せて、賃金の引上げを後押しするほか、小規模企業者からの高額設備投資の需要を踏まえた助成限度額の引上げを行い、支援を強化しています。

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      項目躍進的な事業推進のための設備投資支援事業 内容
      支援対象競争力の強化や生産性向上などを目指す中小企業
      主な支援内容設備等の導入に要する経費の一部の支援
      助成率3/4~4/5(令和7年度第3回の情報を引用)
      助成上限額1億円
      採択予定件数350件(前年250件から拡充)

      2026年度の東京都の助成金を勝ち取るための「3つのキーワード」

      採択率に関わる重要なトレンドは以下の3点です。

      • 賃上げ(賃金引上げ):ほぼ全ての助成制度で「賃上げ」が助成率アップの条件になっています。システム導入による効率化を、従業員の給与に還元する計画を策定することで、東京都からより応援されやすい(採択されやすい)取組になると考えています。
      • 専門家による伴走支援: 東京都から派遣される「専門家のアドバイス」を受けることがセットになっている事業が増えています。自社だけでは気づきにくい観点を教えてもらうことができます。
      • DXとAI:単なる「IT化(紙をデータにする)」ではなく、「DX(データを使ってビジネスを変える)」や「AI活用」が明確に予算として独立しています。DX・AIを活用する計画を策定できれば、東京都からより応援されやすい(採択されやすい)取組になると考えています。

      アプリ・システム開発に使える東京都の助成金申請なら株式会社イチドキリへ!

      株式会社イチドキリは、中小企業庁認定の経営革新等支援機関として、着手金0円・完全成功報酬で補助金申請を徹底サポートします。エンジニア出身の代表を含むプロフェッショナルチームが、東京都の助成金申請の書類策定から獲得まで一貫して伴走し、お客様の熱い想いやビジョンに寄り添いながら最適なプランをご提案します。

      経営力強化に向けた創意工夫チャレンジ促進事業(設備導入等による業務改善コース、新市場・新分野進出コース、賃上げ促進コース)、DX推進トータルサポート事業、中小企業収益力強化サポート事業、躍進的な事業推進のための設備投資支援事業など、システム・アプリ開発に関わる幅広い東京都の助成金制度に精通、申請支援対応しており、システム開発を中心とした助成金・補助金申請のサポート実績を多数保有しています。

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      アプリ・システム開発に使える東京都の助成金に関するよくある5つの質問

      アプリ・システム開発に使える東京都の助成金活用で、中小企業経営者から特によく寄せられる5つの質問にお答えします。

      Q1. 既存アプリ・システムの追加改修や機能追加でも助成金の対象になりますか?

      はい、追加改修や機能追加でも助成対象になる制度も多々あります。例えば、「事業環境変化に対応した経営基盤強化事業(一般コース)」の募集要項の取組例として「既存の商品やサービス等の品質向上の取組」とあります。

      Q2. 複数の助成金に同時に申請することは可能ですか?

      同一の助成対象経費に対して複数の助成金を申請することはできません。同じ設備投資費に対して複数の助成金を同時に申請することは二重受給となり、不正受給とみなされます。

      ただし、異なる経費や異なる用途であれば、複数の助成金制度を併用することは可能です。

      Q3. 助成金はいつもらえるのでしょうか?後払い(精算払い)が基本ですか?

      助成金は後払い(精算払い)が基本です。交付決定後に補助事業を実施し、実績報告の提出を行った後、助成額が確定されます。その後、事務局に対して支払請求を行うことで、ようやく助成金が支払われます。

      具体的には、①設備の購入・支払い完了、②実績報告の提出、③確定検査、④助成金額の確定通知、⑤精算払請求書の提出、⑥助成金の入金という流れです。請求手続き後、2~3か月程度で入金されます。

      Q4. 個人事業主でも東京都の助成金を使えますか?

      個人事業主も東京都の助成金を利用可能です。ただし、「事業環境変化に対応した経営基盤強化事業(一般コース)」の募集要項の申請要件には「納税地が都内にあること」と明記されています。また個人事業主の場合は、確定申告書の控えや所得税の納税証明書など、法人とは異なる提出書類が必要となります。

      ちなみに、法人も本店(実施場所が都内の場合は支店でも可)の登記が都内にあることが求められます。

      Q5. 東京都の助成金の申請代行を依頼するメリットは何ですか?

      東京都の助成金の申請代行を依頼する主なメリットは3点です。第一に、募集要項の確認、必要書類の準備、申請書類の作成など、複雑で時間のかかる作業を専門家に任せることで時間と労力を大幅に削減できます。

      第二に、専門家による申請内容のブラッシュアップにより採択率の向上が期待できます。第三に、助成金の公募情報は頻繁に更新されるため、常に最新情報を把握している専門家に依頼することで、自社に最適な補助金を紹介してもらえます。

      まとめ:2026年は「DX×助成金」が企業の命運を分ける

      2026年1月30日に発表された東京都の予算案。その全容を見ると、東京都の本気が伝わってきます。
      特に「経営力強化に向けた創意工夫チャレンジ促進事業」や「DX推進トータルサポート事業」は、単なる資金的な支援にとどまらず、専門家の伴走支援をセットにすることで、中小企業の「確実に変わる力」を後押しする内容となっています。

      システム開発やアプリ導入は、本来大きな投資リスクを伴うものです。しかし、今回ご紹介した制度を賢く活用すれば、最大4/5(実質負担20%)という圧倒的に有利な条件で、自社の競争力を高めるインフラを整えることができます。

      私たちの強み

      私たちは、単なる申請代行会社ではありません。 エンジニア出身の代表率いるプロフェッショナル集団として、技術的な裏付けに基づいた「通る事業計画書」を策定します。

      • 着手金0円・顧問料0円の完全成功報酬型: 採択されるまで、お客様にリスクはありません。
      • 圧倒的な採択実績: 東京都の制度にも精通し、多くのITプロジェクトを成功に導いてきました。
      • 開発案件に精通しているプロ集団: システムの追加改修やAI導入など、現場レベルの相談もスムーズです。(弊社は申請支援のみを行い、開発業務の請負や特定のシステム会社の指定等は一切行いません。)

      「自社で検討しているシステムは対象になる?」「どのコースが一番あうの?」といった疑問をお持ちの方は、ぜひお早めにご相談ください。2026年度の予算を最大限に活用し、御社のビジネスを次のステージへと加速させましょう。

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      記事の執筆者

      株式会社イチドキリ 代表取締役
      徳永 崇志

      兵庫県西脇市出身。岡山大学教育学部出身。大手システムインテグレーターでエンジニアとしてのキャリアをスタートし、その後、株式会社リクルートで教育系SaaS「スタディサプリ」の法人営業に携わる。株式会社レアジョブではAIを用いた新規事業の立ち上げに従事し、リリース1年で国内受験者数No.1のテストに導く。株式会社素材図書で副社長兼執行役員を務め、事業再構築補助金を活用した新規事業開発・立ち上げを担当。その後株式会社イチドキリを設立。現在は経済産業省(中小企業庁)認定の経営革新等支援機関として、システム開発に特化した補助金コンサルティング事業を運営。 2016年に「基本情報技術者試験」合格、2024年にGoogle認定資格「Google AI Essentials」、厚生労働省「精神・発達障害者しごとサポーター」取得。

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